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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  40 lines
  1. *******************************
  2. * Epimorphin family signature *
  3. *******************************
  4.  
  5. The following proteins have been shown to be evolutionary related [1,2,3]:
  6.  
  7.  - Epimorphin,  a  mammalian mesenchymal protein which plays an essential role
  8.    in epithelial morphogenesis.
  9.  - Syntaxin  A (also known as antigen HPC-1) and syntaxin B which are synaptic
  10.    proteins which   may  be  involved  in  docking  of  synaptic  vesicles  at
  11.    presynaptic active zones.
  12.  - Yeast  PEP12  which  is  required  for  the  transport  of proteases to the
  13.    vacuole.
  14.  - Yeast  SED5 which is required for the fusion of transport vesicles with the
  15.    Golgi complex.
  16.  - Yeast SSO1 and SSO2  which are  required for vesicle fusion with the plasma
  17.    membrane.
  18.  
  19. The above  proteins  share  the following characteristics: a size ranging from
  20. 30 Kd  to  40  Kd;  a  C-terminal extremity which is highly hydrophobic and is
  21. probably involved  in  anchoring  the protein to the membrane; a central, well
  22. conserved region, which seems to be in a coiled-coil conformation.
  23.  
  24. The pattern specific for  this family is based on the most conserved region of
  25. the coiled coil domain.
  26.  
  27. -Consensus pattern: R-x(3)-[LIVM]-x(2)-[LIVM]-E-x(2)-[LIVM]-x-E-[LIVM]-x(2)-
  28.                     [LIVM]-F-x(2)-[LIVM]-x(2)-[LIVMF]-V-x(2)-Q-[GQ]-x(2)-
  29.                     [LIVM]-[DNQ]-x-[LIVM]-[DE]-x-N
  30. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32. -Last update: October 1993 / First entry.
  33.  
  34. [ 1] Spring J., Kato M., Bernfield M.
  35.      Trends Biochem. Sci. 18:124-125(1993).
  36. [ 2] Pelham H.R.B.
  37.      Cell 73:425-426(1993).
  38. [ 3] Aalto M., Ronne H., Keraenen S.
  39.      EMBO J. 11:4095-4104(1993).
  40.